Крупнейшая луна Плутона, Харон, меньше планеты всего в два раза, так что на самом деле Плутон-Харон является двойной системой. Харон образовался в результате столкновения Плутона с крупным небесным телом около четырех миллиардов лет назад. Образование других спутников, размеры которых колеблются в пределах от нескольких до нескольких десятков километров, и их орбиты, удалось объяснить сотрудникам Юго-западного исследовательского университета. Множество обломков, созданных при ударе, родившем Харон, продолжило столкновения. При этом большая часть материала была потеряна слабым гравитационным полем Плутона, но небольшая его часть объединилась в новые луны. Они также сталкивались, терялись системой. Весь процесс занял около миллиона лет. По его окончании у Плутона, кроме Харона, осталось лишь небольшое число небольших лун, обращающихся по специфическим орбитам: они имеют орбитальный резонанс 1:3:4:5:6, причем единица отвечает орбите Харона. Именно такая специфическая конфигурация оказалась устойчивой в двойной системе слабо притягивающих тел.